مدیریت و راهبری
رییس پژوهشگاه
دکتر مرتضی توکلی
از اسفندماه سال 1400 تا کنون
معاون پژوهشی و آموزشی پژوهشگاه دکتر علی مهدی نیا | معاون فناوری پژوهشگاه دکتر سعید نجفیمهندسی دریا | معاون اداری، مالی و توسعه منابع پژوهشگاه محمد کاظم حبیبیان |
رییس پژوهشکده علوم دریایی دکتر ابوالفضل صالحدکتری شیمی | رییس پژوهشکده فناوری و مهندسی دریا دکتر محمد حسین کاظمی نژاددکتری مهندسی آب | رییس پژوهشکده علوم جوی دکتر مسعود مرادیدکتری سنجش از دور |
رییس مرکز بندرعباس دکتر صمد حمزه ئیدکتری فیزیک دریا | رییس مرکز بوشهر دکتر مریم قائمیدکتری شیمی تجزیه | رییس مرکز نوشهر دکتر احمد منبوهیدکتری شیمی تجزیه |
رییس مرکز چابهار دکتر کمال الدین کردکتری شیمی تجزیه |